基于Nanopore測序技術(shù)分析廣東地區(qū)1株P(guān)RRSV-2的基因組特征

摘要： 為促進(jìn)Nanopore測序技術(shù)在美洲型豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV-2)全基因組測序中的應(yīng)用并進(jìn)一步了解當(dāng)前廣東地區(qū)PRRSV-2全基因組特征，本試驗(yàn)從廣東地區(qū)某屠宰場采集1份PRRSV-2陽性樣本，提取核酸進(jìn)行靶向擴(kuò)增，對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行文庫構(gòu)建和測序，使用Samtools和Medaka等軟件對(duì)測序數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析和拼接，得到樣本的全基因組序列。選取5′端1～4 50...