綠孔雀腸道菌群基因組特征和耐藥性的宏基因組測序分析

摘要： 為明確綠孔雀腸道菌群耐藥基因及可移動元件的分布特征，對云南野生動物園，開放式飼養(yǎng)的健康綠孔雀糞便采樣，提取其DNA后進行宏基因組測序。使用NCBI-nr數(shù)據(jù)庫進行物種注釋及相對豐度計算，得出綠孔雀腸道菌群物種分布特征；通過功能注釋及聚類分析，得出耐藥基因的類型及分布特征。使用BLAST程序搜尋樣本中的可移動耐藥基因，并與不同的地域、宿主和體位的細菌基因組進行對比，分析其差異及近...