北京黑豬全基因組ROH檢測和選擇信號分析

摘要： 旨在基于長純合片段(ROH)和選擇信號iHS分析北京黑豬群體的遺傳結構，挖掘與經(jīng)濟性狀相關的候選基因。本研究的對象為北京黑豬群體，平均日齡為210 d。對729頭北京黑豬的illumina Porcine 50K芯片數(shù)據(jù)進行質控和填充后，進行ROH和iHS的分析。本研究選擇參與組成ROHs的前1%的SNPs作為ROH島的閾值，將超過此閾值的區(qū)域稱為ROH島。保留標準化的|iHS...