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水和土壤接觸可以帶來污染，因為土壤會接受大氣沉降，徑流的沖刷作用也會使雨水中含有一定含量的有機物，例如COD，SS，TN，TP等等.但是，水體總會有背景值，如果雨水徑流攜帶的污染物含量較低，低于水體的環(huán)境容量（可以理解為水體凈化能力），那么我們可以認(rèn)為他無害，而且還能補充水源，如果他的污染程度低于水體的污染程度，那么我們可以認(rèn)為他對水體有稀釋和凈化作用。
雨水屬于輕污染水，其受污染的程度與地理位置、氣候條件、環(huán)境有一定的關(guān)系，在收集的過程中雨水會受到不同程度的污染，其中的雜質(zhì)是由降雨中的基本物質(zhì)和流經(jīng)地區(qū)所造成的外加雜質(zhì)組成，主要含有硝酸根、硫酸根、氯、鈉、銨、鎂和鈣等離子（濃度大多在 10mg/L 以下）和一些有機物質(zhì)（主要是揮發(fā)性化合物），同時還存在少量的重金屬（如鎘、銅、鉻、鎳、鉛、鋅），雨水中雜質(zhì)的濃度不僅受降雨地區(qū)污染程度的影響，而且與收集方式有密切的關(guān)系，例如,來自屋頂上的降雨徑流除初期受到輕度污染外，后期徑流一般水質(zhì)良好；機動車道上的降雨徑流，由于機動車輛的磨損而含有金屬、橡膠、燃油等污染物質(zhì)。
雨水回用可以用作景觀水、生產(chǎn)循環(huán)水、生活雜用水、灌溉及地下水回灌等。雨水凈化工藝視水質(zhì)和使用目的而確定，若出水用作雜用水、景觀水等，則優(yōu)先考慮簡單的物化處理技術(shù)；若對出水水質(zhì)要求很高，則需要對雨水進行深度處理，如膜分離技術(shù)活性炭吸附等，雨水凈化還可以采用生態(tài)處理技術(shù)，即依靠土壤、植物、微生物組成的生態(tài)系統(tǒng)凈化雨水。
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