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異構(gòu)計算

異構(gòu)計算技術(shù)從80年代中期產(chǎn)生,由于它能經(jīng)濟(jì)有效地獲取高性能計算能力、可擴(kuò)展性好、計算資源利用率高、發(fā)展?jié)摿薮?,目前已成為并?分布計算領(lǐng)域中的研究熱點(diǎn)之一。

概念:

  在異構(gòu)計算系統(tǒng)上進(jìn)行的并行計算通常稱為異構(gòu)計算。人們已從不同角度對異構(gòu)計算進(jìn)行定義,綜合起來我們給出如下定義:異構(gòu)計算是一種特殊形式的并行和分布式計算,它或是用能同時支持simd方式和mimd方式的單個獨(dú)立計算機(jī),或是用由高速網(wǎng)絡(luò)互連的一組獨(dú)立計算機(jī)來完成計算任務(wù)。它能協(xié)調(diào)地使用性能、結(jié)構(gòu)各異地機(jī)器以滿足不同的計算需求,并使代碼(或代碼段)能以獲取最大總體性能方式來執(zhí)行。

  概括來說,理想的異構(gòu)計算具有如下的一些要素:

 ?。?)它所使用的計算資源具有多種類型的計算能力,如simd、mimd、向量、標(biāo)量、專用等;(2)它需要識別計算任務(wù)中各子任務(wù)的并行性需求類型;(3)它需要使具有不同計算類型的計算資源能相互協(xié)調(diào)運(yùn)行;(4)它既要開發(fā)應(yīng)用問題中的并行性,更要開發(fā)應(yīng)用問題中的異構(gòu)性,即追求計算資源所具有的計算類型與它所執(zhí)行的任務(wù)(或子任務(wù))類型之間的匹配性;(5)它追求的最終目標(biāo)是使計算任務(wù)的執(zhí)行具有最短時間。

  可見,異構(gòu)計算技術(shù)是一種使計算任務(wù)的并行性類型(代碼類型)與機(jī)器能有效支持的計算類型(即機(jī)器能力)最相匹配、最能充分利用各種計算資源的并行和分布計算技術(shù)。

原理:

  1、異構(gòu)計算系統(tǒng)。

  它主要由以下三部分組成:(1)一組異構(gòu)機(jī)器。(2)將各異構(gòu)機(jī)器連接起來的高速網(wǎng)絡(luò)。它可以是商品化網(wǎng)絡(luò),也可以是用戶專門設(shè)計的。(3)相應(yīng)的異構(gòu)計算支撐軟件。

  2、異構(gòu)計算的基本工作原理。

  異構(gòu)計算需求在析取計算任務(wù)并行性類型基礎(chǔ)上,將具有相同類型的代碼段劃分到同一子任務(wù)中,然后根據(jù)不同并行性類型將各子任務(wù)分配到最適合執(zhí)行它的計算資源上加以執(zhí)行,達(dá)到使計算任務(wù)總的執(zhí)行時間為最小。下面通過一個簡單例子來說明異構(gòu)計算的基本工作原理。

  假設(shè)在某一基準(zhǔn)串行計算機(jī)上執(zhí)行某一給定計算任務(wù)的時間為ts,其中向量、mimd、simd以及sisd各類子任務(wù)所占執(zhí)行時間的百分比分別為30%、36%、24%和10%。假設(shè)某向量機(jī)執(zhí)行上述各類子任務(wù)相對于基準(zhǔn)串行機(jī)的加速比分別為30、2、8和1.25,則在該向量機(jī)上執(zhí)行此任務(wù)所需的總時間為

  tv=30%ts/30+36%ts/2+24%ts/8+10%ts/1.25=0.30ts,

  故相應(yīng)的加速比為sv=ts/tv=ts/0.3ts=3.33

  若上述向量機(jī)與其他的mimd機(jī)、simd機(jī)以及一臺高性能工作站(sisd型)構(gòu)成一個異構(gòu)計算系統(tǒng),并假設(shè)mimd機(jī)、simd機(jī)以及工作站執(zhí)行相匹配子任務(wù)的加速比分別為36、24和10,則在該異構(gòu)計算系統(tǒng)上執(zhí)行同樣任務(wù)所需時間就變?yōu)?/p>

  thet=30%ts/30+36%ts/36+24%ts/24+10%ts/10+tc

  其中tc為機(jī)器間交互開銷時間,假設(shè)需2%ts時間,則thet=0.06ts,從而相應(yīng)的加速比為shet=ts/0.06ts=16.67。

  由上例可見,異構(gòu)計算系統(tǒng)可比同構(gòu)計算系統(tǒng)獲取高得多的加速比。這主要是因?yàn)橥瑯?gòu)計算系統(tǒng)中的加速比只是靠并行性開發(fā)獲取的,而異構(gòu)計算系統(tǒng)中的加速比除了并行性之外,更主要的是靠開發(fā)異構(gòu)性獲得的(即不同類型子任務(wù)與相應(yīng)類型的計算資源相匹配),盡管此時會有相應(yīng)的交互開銷。交互開銷越小,異構(gòu)計算的優(yōu)越性就越加明顯。

分類:

  異構(gòu)計算按以何種形式來提供計算類型多樣性,可分為系統(tǒng)異構(gòu)計算(shc-system heterogeneous computing)和網(wǎng)絡(luò)異構(gòu)計算(nhc-network heterogeneous computing)兩大類。shc以單機(jī)多處理器形式提供多種計算類型,而nhc則以網(wǎng)絡(luò)連接的多計算機(jī)形式提供多種計算類型。

  根據(jù)異構(gòu)性實(shí)現(xiàn)方式不同,即是空間異構(gòu)性還是時間異構(gòu)性,shc和nhc各自又可進(jìn)一步分為兩類。shc分為單機(jī)多計算方式和單機(jī)混合計算方式兩大類,前者在同一時刻允許以多種計算方式執(zhí)行任務(wù),后者在同一時刻只允許以一種計算方式執(zhí)行任務(wù),但在不同時刻計算可從一種方式自動切換到另一種方式,如simd和mimd方式間的切換。前者的實(shí)例有美國hughes研究實(shí)驗(yàn)室和mit共同研制的圖像理解系統(tǒng)結(jié)構(gòu)(iua),它是多層異構(gòu)系統(tǒng)結(jié)構(gòu),按圖像理解層次要求設(shè)計每一層,低層是simd位串網(wǎng)絡(luò)(4096),用來處理像素級操作(如圖像增強(qiáng)),中層是由64個數(shù)字信號處理(dsp芯片構(gòu)成的,以spmd或mimd(中粒度)方式執(zhí)行模式分類等操作,頂層是一個通用mimd(粗粒度)機(jī)器,完成場景和動作分析等知識處理操作。后者的實(shí)例為美國普渡大學(xué)研制的pasm系統(tǒng)原型,由16個pe(處理單元)組成的系統(tǒng),它們可動態(tài)地加以劃分以形成各種大小的獨(dú)立的混合方式子機(jī)器,執(zhí)行方式可按需要在simd和mimd之間自動切換。

  nhc可進(jìn)一步分為同類異型多機(jī)方式和異類混合多機(jī)方式兩類。同類異型多機(jī)方式中所使用的多機(jī),它們的結(jié)構(gòu)屬同一類,即支持同一種并行性類型(如simd、mimd、向量等類型之一),但型號可能不同,因此性能可以各有差異。通常的now或cow為同類同型多機(jī)方式,因此可看成是同類異型多機(jī)方式中的特例。異類混合多機(jī)方式中所使用的多機(jī),它們的結(jié)構(gòu)則屬不同類型。

層次結(jié)構(gòu):

  網(wǎng)絡(luò)異構(gòu)計算系統(tǒng)主要由一組異構(gòu)計算機(jī)、一個連接所有機(jī)器的高速網(wǎng)絡(luò)和一個并行編程環(huán)境所組成。邏輯上這種系統(tǒng)可分為三個層次:網(wǎng)絡(luò)層、通信層和處理層。如圖1所示。

  網(wǎng)絡(luò)層主要用來連接在不同地點(diǎn)的計算機(jī),如圖1中的計算站a和計算站b,并考慮其中消息傳遞的路由選擇、網(wǎng)絡(luò)流優(yōu)化和網(wǎng)絡(luò)排隊(duì)理論等問題,這與傳統(tǒng)的計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)設(shè)計類似。

  通信層工作于網(wǎng)絡(luò)層之上,主要為系統(tǒng)中各種不同的計算機(jī)提供能夠相互通信的機(jī)制。通信工具軟件應(yīng)提供使眾多異構(gòu)計算機(jī)集合可視為是一個單一的系統(tǒng)映像、單個虛擬異構(gòu)并行機(jī)的機(jī)制。這將方便用戶編程。這種通信工具通常提供一組原語來提供各種通信。典型流行的通信工具是pvm(并行虛擬機(jī))和mpi(消息傳遞標(biāo)準(zhǔn)接口)。

  處理層主要用來管理異構(gòu)機(jī)器組并保證任務(wù)的高效執(zhí)行。它所提供的主要服務(wù)包括編程環(huán)境和語言支持、應(yīng)用任務(wù)的類型分析和任務(wù)劃分、任務(wù)的映射與調(diào)度以及負(fù)載平衡等。

主要問題:

  異構(gòu)計算處理過程本質(zhì)上可分為三個階段:并行性檢測階段、并行性特征(類型)析取階段以及任務(wù)的映射和調(diào)度階段。并行性檢測不是異構(gòu)計算特有的,同構(gòu)計算也需要經(jīng)歷這一階段??捎貌⑿泻头植加嬎阒械某R?guī)方法加以處理。并行性特征析取階段是異構(gòu)計算特有的,這一階段的主要工作是估計應(yīng)用中每個任務(wù)的計算類型參數(shù),包括映射及對任務(wù)間通信代價的考慮。任務(wù)映射和調(diào)度階段(也稱為資源分配階段)主要確定每個任務(wù)(或子任務(wù))應(yīng)映射哪臺機(jī)器上執(zhí)行以及何時開始執(zhí)行。

  從用戶來看,上述的異步計算處理過程可用兩種方法來實(shí)現(xiàn)。第一種是用戶指導(dǎo)法,即由用戶用顯式的編譯器命令指導(dǎo)編譯器完成對應(yīng)用代碼類型分析及有關(guān)任務(wù)的分解等工作,這是一種顯式開發(fā)異構(gòu)性和并行性方法,較易于實(shí)現(xiàn),但對用戶有一定要求,需將異構(gòu)計算思想融入用戶程序中。另一種是編譯器指導(dǎo)法,需將異構(gòu)思想融入編譯器中,然后由具有“異構(gòu)智力”的編譯器自動完成應(yīng)用代碼類型分析、任務(wù)分解、任務(wù)映射及調(diào)度等工作,即實(shí)現(xiàn)自動異構(gòu)計算。這是一種隱式開發(fā)異構(gòu)性和并行性方法,是異構(gòu)計算追求的終極目標(biāo),但難度很大,對編譯器要求很高。

  自動異構(gòu)計算的概念性模型如圖2所示。首先對兩個對象進(jìn)行分析,一是異構(gòu)計算系統(tǒng)中的機(jī)器集,二是求解的應(yīng)用程序。為了獲取最好的執(zhí)行效果,對它們不但進(jìn)行定性分析,還需進(jìn)行相應(yīng)的定量分析。

  整個異構(gòu)計算處理過程可分為以下四個階段:第一階段主要是對各臺機(jī)器進(jìn)行計算特征的分類,得出異構(gòu)計算系統(tǒng)所能完成的計算類型;按代碼塊統(tǒng)計應(yīng)用對計算特征的需求并加以分類;用基準(zhǔn)程序測試各機(jī)器的性能參數(shù),包括速度參數(shù)及機(jī)器間通信性能參數(shù),生成對應(yīng)的兩個機(jī)器速度性能矩陣和通信帶寬矩陣。將程序按計算類型分類劃分;估算各子任務(wù)的計算量和子任務(wù)間通信量,生成相應(yīng)的任務(wù)dag圖。dag圖中結(jié)點(diǎn)上的數(shù)值表示子任務(wù)計算量,弧上的數(shù)值表示兩結(jié)點(diǎn)間通信量。

  第二階段主要是根據(jù)dag和速度性能矩陣計算出每個子任務(wù)在各臺機(jī)器上的執(zhí)行時間,生成時間性能矩陣;根據(jù)通信性能矩陣和子任務(wù)的通信量計算各子任務(wù)間的通信時間,生成通信時間矩陣。

  第三階段根據(jù)前兩個階段結(jié)果,給出各子任務(wù)到各機(jī)器的映射和符合任務(wù)dag圖偏序關(guān)系的調(diào)度。映射和調(diào)度可以是靜態(tài)或動態(tài)的,動態(tài)調(diào)度需根據(jù)機(jī)器負(fù)載和網(wǎng)絡(luò)狀態(tài)信息進(jìn)行。

  第四階段為執(zhí)行。

應(yīng)用與研究:

  異構(gòu)計算的應(yīng)用范圍很廣,幾乎所有涉及巨大挑戰(zhàn)性問題的求解都可用異構(gòu)計算進(jìn)行經(jīng)濟(jì)有效的求解。典型的應(yīng)用包括圖像理解、質(zhì)點(diǎn)示蹤、聲束形成、氣候建模、湍流對流混合模擬以及多媒體查詢等。這些應(yīng)用中通常都含有多種不同的計算類型的需求,因此很適合于用異構(gòu)計算來進(jìn)行求解。

  1、未來應(yīng)重點(diǎn)開展異構(gòu)混合多機(jī)方式的網(wǎng)絡(luò)異構(gòu)計算的研究,它代表著發(fā)展趨向,且較經(jīng)濟(jì)有效;2、自動異構(gòu)計算是長期追求目標(biāo),在現(xiàn)階段宜采用用戶指導(dǎo)方法來進(jìn)行研究和開發(fā);3、應(yīng)盡量利用現(xiàn)有成熟工具如pvm和mpi來開展異構(gòu)計算的研究和開發(fā);4、應(yīng)注意開展異構(gòu)計算的理論分析和建模、性能估計模型、有關(guān)軟件工具以及異構(gòu)計算中任務(wù)映射和調(diào)度算法等方面的研究;5、應(yīng)研究如何使異構(gòu)計算系統(tǒng)具有良好的單一系統(tǒng)映像。


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